R语言安装DESeq2包
2020-10-10 本文已影响0人
谢京合
DESeq2用来处理转录组数据。那么先来完成第一步:安装。
1、传统方式安装
install.packages("DESeq2")
麻蛋,报错了!!!!为什么受伤的总是我。
package ‘DESeq2’ is not available (for R version 4.0.2)
2、开启查阅资料模式,然后得到的结论是这个包的安装需要利用BiocConductor或者BiocManager。
但是根据网上大神们的分享,尝试了各种方法。报错越来越多,并且越来越看不懂。
最后决定直接进入DESeq2的package官网上看吧。https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/DESeq2.html
3、最后按照Bioconductor指示安装,成功。
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("DESeq2")
library(DESeq2)