美化cytoscape图片
2020-10-22 本文已影响0人
柳叶刀与小鼠标
- 首先我们进入STRING网站的官网(网址为https://string-db.org/)，选择好蛋白的输入方式后，输入一列差异基因，STRING网站对基因的限制条件是不超过2000个基因，格式也是每行一个基因名(蛋白名)。先选择“Multiple protenins”，然后输入基因名，最后选择“Homo sapiens”。
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然后点击“SEARCH”选项，继续点击“CONTINUE”选项。
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直接点击“Exports”选项，下载TSV格式的文件保存。
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导入数据：File-Import -Network-file,然后选择TSV格式的文件。
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Layout>Circular layout
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我们依次点击Tools- NetworkAnalyzer-Network Analysis-Generate style from statistics。
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修改线图宽度为1
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最终成图
image.png
