R包安装遇到Java版本问题
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装完之后，发现还是没有解决，我本人完全不懂Java，便按照如下链接对Java进行了配置：
- 在terminal中运行
java -version
查看已安装的版本，正常情况下就应该有以下内容。
查看Java版本
如果没有版本信息，说明 jdk 没有正确安装，到 Oracle 官网下载一个 jdk 并安装就可以了。
- 检查 JAVA_HOME 变量是否设置正确
echo $JAVA_HOME
以查看 JAVA_HOME 变量。如果结果是一个路径，则一切正常。而如果没有任何显示，则需要做一下配置，我就是没有任何显示，所以按照以下进行了配置：
在 terminal 中运行
open .bash_profile
打开 .bash_profile，这是配置环境变量的地方。如果打开失败则是因为没有这个文件，先用
touch .bash_profile
新建这一文件，然后再打开它进行编辑。输入代码：
export JAVA_HOME=`/usr/libexec/java_home`
保存。运行
source .bash_profile
来应用更改，重启 terminal 再查看 JAVA_HOME 便能看到路径了。
路径
快捷键command+shift+G打开“前往文件夹”，可以按以上显示的路径进入查看。
- 重置 R 中的 java 环境变量
在terminal中，使用
sudo R CMD javareconf
- 在 RStudio 中配置 java 环境变量
打开 RStudio，在控制台运行
options("java.home")
如果结果为 NULL，则环境变量为空，需要设置。参考下列语句对环境变量进行设置：
options("java.home"="/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-13.0.2.jdk/Contents/Home")#"/Libraray/Jav...ts/Home"这一串需要是你的JAVA_HOME路径
- 检查其他问题
在完成上述步骤后，极大可能这一问题已经解决了，但我仍然不能加载 rJava 库。为什么呢？回头看看报错信息的一部分：
Library not loaded: /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-11.0.1.jdk/Contents/Home/lib/server/libjvm.dylib
lib 路径为什么凭空冒出来一个不存在的版本号11.0.1呢？我可从来没有安装过这个版本的 jdk，尝试着解决这个问题：
在控制台运行
library(rJava)
之前，将目录名 jdk-11.0.4.jdk 暂时改为 jdk-11.0.1.jdk
- 问题原因推测
rJava 包的安装需要用到 java 运行库，加载过程使用的脚本 rJava.so 没有使用 java 的环境变量，而是通过检测系统的 jdk 版本直接读取指定目录中的 lib 文件，这一个文件目录在 jdk11 中被固定为 11.0.1，因此任意更高版本的 jdk11 都将遇到这一错误。其他版本 jdk 也可能会有类似错误。
最后，不要忘记把 jdk 目录名改回来
以上修改方法均参考自https://zhuanlan.zhihu.com/p/84978204?from_voters_page=true
解决完之后，我可以正常加载xlsx和rJava包了，说明配置成功！
但是我在安装这个包的时候发现了以下问题而不能安装！！！！
安装MSGFplus报错
我查了一下，发现官网上说这个问题的出现是因为Java前后版本的不同所导致的，官网上给了一个文件：
官网问题的解决
但是不知道该怎么具体操作，但知道是版本问题，所以我重新下载了一个旧版本的Java,一共重新下了俩：下载了13.不行，重新下载了1.8.0_241
安装包
下载的Java
将两个高版本的删掉之后，只保留了1.8.0_241，然后在terminal中，查看了一下，发现自动变成了1.8.0_241版本
image.png
然后直接去R studio中，设置环境变量
options("java.home"="/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-1.8.0_241.jdk/Contents/Home")
install.packages("~/Downloads/MSGFplus_1.20.0.tgz", repos = NULL, type = .Platform$pkgType)
library(MSGFplus)
library(xlsx)
library(rJava)
均没问题！！
小结：以后再遇到Java版本问题，需要升级的话，直接下载新版本，删掉旧版本，在terminal确定安装好即可，然后去R里重新配置。
