2020-12-22为ggplot图形标记markdown文字
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iColors
原文：https://cran.r-project.org/web/packages/ggtext/vignettes/plotting_text.html
ggtext包定义了两个新的geoms, geom_richtext()和geom_textbox()，用于为图形进行文本标记， 分别绘制简单的文本标记（没有自动换行）和文本框（带自动换行）
使用geom_richtext()，能将markdown形式的文本标置于图形中。可以看做是以前常用的geom_label()或geom_text()的代替品。
例子1——简单文本标记
- 使用r2的值添加图形注释，用iris数据为例，用传统的geom_text()标记如下：
library(ggplot2)
library(dplyr)
library(glue)
iris_cor <- iris %>%
group_by(Species) %>%
summarize(r_square = cor(Sepal.Length, Sepal.Width)^2) %>%
mutate(
# location of each text label in data coordinates
Sepal.Length = 8, Sepal.Width = 4.5,
# text label containing r^2 value
label = glue("r^2 = {round(r_square, 2)}")
)
iris_cor
#> # A tibble: 3 x 5
#> Species r_square Sepal.Length Sepal.Width label
#> <fct> <dbl> <dbl> <dbl> <glue>
#> 1 setosa 0.551 8 4.5 r^2 = 0.55
#> 2 versicolor 0.277 8 4.5 r^2 = 0.28
#> 3 virginica 0.209 8 4.5 r^2 = 0.21
iris_facets <- ggplot(iris, aes(Sepal.Length, Sepal.Width)) +
geom_point() +
geom_smooth(method = "lm", formula = y ~ x) +
facet_wrap(~Species) +
theme_bw()
iris_facets +
geom_text(
data = iris_cor,
aes(label = label),
hjust = 1, vjust = 1
image.png
代码可以work，但是结果不让人满意。1）r是数学变量，应该斜体。2）2应该是上标不是^2。用geom_richtext()可以轻松创建markdown标记。
library(ggtext)
iris_cor_md <- iris_cor %>%
mutate(
# markdown version of text label
label = glue("*r*<sup>2</sup> = {round(r_square, 2)}")
)
iris_cor_md
#> # A tibble: 3 x 5
#> Species r_square Sepal.Length Sepal.Width label
#> <fct> <dbl> <dbl> <dbl> <glue>
#> 1 setosa 0.551 8 4.5 *r*<sup>2</sup> = 0.55
#> 2 versicolor 0.277 8 4.5 *r*<sup>2</sup> = 0.28
#> 3 virginica 0.209 8 4.5 *r*<sup>2</sup> = 0.21
iris_facets +
geom_richtext(
data = iris_cor_md,
aes(label = label),
hjust = 1, vjust = 1
)
image.png
默认情况下，geom_richtext() 要给文本加一个框，可以通过设置填充色和外框线的颜色让它不可见 (fill = NA, label.colour = NA)。
iris_facets +
geom_richtext(
data = iris_cor_md,
aes(label = label),
hjust = 1, vjust = 1,
# remove label background and outline
fill = NA, label.color = NA,
# remove label padding, since we have removed the label outline
label.padding = grid::unit(rep(0, 4), "pt")
)
image.png
如同ggplot2一样，可以各自选择偏爱的标记线、填充和文章的颜色。
iris_facets +
aes(colour = Species) +
geom_richtext(
data = iris_cor_md,
aes(
label = label,
fill = after_scale(alpha(colour, .2))
),
text.colour = "black",
hjust = 1, vjust = 1
) +
theme(legend.position = "none")
image.png
还可以旋转文字标记（虽然不建议这么做）。
iris_facets +
aes(colour = Species) +
geom_richtext(
data = iris_cor_md,
aes(
x = 7.5,
label = label,
fill = after_scale(alpha(colour, .2))
),
text.colour = "black",
hjust = 1, vjust = 1,
angle = 30
) +
theme(legend.position = "none")
image.png
文本框
用geom_textbox()为图形添加markdown形式的文本框（带自动换行）。可以指定文本框的宽度，可以是绝对宽度（如"cm","pt", "in")，也可以是相对宽度(如"npc")。
df <- data.frame(
x = 0.1,
y = 0.8,
label = "*Lorem ipsum dolor sit amet,* consectetur adipiscing
elit. Quisque tincidunt eget arcu in pulvinar. Morbi varius leo
vel consectetur luctus. **Morbi facilisis justo non fringilla.**
Vivamus sagittis sem felis, vel lobortis risus mattis eget. Nam
quis imperdiet felis, in convallis elit."
)
p <- ggplot() +
geom_textbox(
data = df,
aes(x, y, label = label),
width = grid::unit(0.73, "npc"), # 73% of plot panel width
hjust = 0, vjust = 1
) +
xlim(0, 1) + ylim(0, 1)
p
image.png
如果改变了图形的宽度，文本框会随着改变，文本自动适应。
image.png
用hjust和vjust对齐x和y轴定义的参考点，它不会影响文本框中的文本。文本框的文本对齐，可以用halign和valign。例如用halign=0.5进行中心文本对齐。
ggplot() +
geom_textbox(
data = df,
aes(x, y, label = label),
width = grid::unit(0.73, "npc"), # 73% of plot panel width
hjust = 0, vjust = 1,
halign = 0.5 # centered text
) +
xlim(0, 1) + ylim(0, 1)
image.png
文本框虽然不能任意角度旋转，但是可以有四个选择。
df <- data.frame(
x = 0.5,
y = 0.5,
label = "The quick brown fox jumps over the lazy dog.",
orientation = c("upright", "left-rotated", "inverted", "right-rotated")
)
ggplot() +
geom_textbox(
data = df,
aes(x, y, label = label, orientation = orientation),
width = grid::unit(1.5, "in"),
height = grid::unit(1.5, "in"),
box.margin = grid::unit(rep(0.25, 4), "in"),
hjust = 0, vjust = 1
) +
xlim(0, 1) + ylim(0, 1) +
scale_discrete_identity(aesthetics = "orientation")
image.png
