pfastq-dump的使用

多核版的fastq-dump

单端：

for i in *sra; do pfastq-dump --gzip --threads 8 ./$i ; done

双端：

for i in *sra; do pfastq-dump --split-3 --gzip --threads 8 ./$i ; done

直接用sra号下载并解压fastq文件：

单端：

for i in SRR*; do pfastq-dump --gzip --threads 8 -s $i ; done

双端：

for i in SRR*; do pfastq-dump --split-3 --gzip --threads 8 -s $i ; done