生物信息学

ggplot2基础画图-密度图

2020-04-30  本文已影响0人  bioYIYI

密度图也是比较常用的一种数据分布可视化的方法。今天小编分享一下用ggplot2绘制密度图的方法,代码很简单,但省去了你自己调图的时间~

示例

image.png

代码

#读入文件
dat<-read.table("data",header=TRUE,sep='\t')
#预处理
Class<-dat$Item
VAF<-dat$VAF
#画图
ggplot(dat,aes(x=VAF,fill=Class,alpha = 1/10))+geom_density()+xlab('VAF')+ylab('Density')
ggsave('blood_cell_compare_VAF.density.png',dpi = 1080)

其中输入文件格式:


image.png

注:如果有多组,在“Item”列给组名就行
如果你得到了帮助,不要吝啬留下你的赞哦~

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