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转录组测序数据分析入门1---linux常用命令回顾

2021-01-26  本文已影响0人  Seurat_Satija

生信技能树转录组课前老师带领回顾了linux常用命令,我觉得这个思维导图对记忆练习很有帮助,也学着做了一个。后面还要对照着多加补充练习。
常用命令总结如下

转录组数据分析入门1---linux常用命令回顾.png

1.基础命令:

    文件和文件夹:mkdir/rmdir-p,cd,pwd,ls(ll-h),rm -rf,mv,cp,ln-s,vim,touch,
    压缩与解压缩:tar-zxvf,gzip/gunzip
    查看:cat-A/tac,head/tail -n,more/less -SN,
    快捷键: ctrl+a:跳到行首,ctrl+e:跳到行尾,
    alt+方向键:向指定方向移动一个tab键的宽度,
   ctrl+c:退出当前命令,另起一行,重新输入

2.高级命令

三驾马车 要求掌握
    grep 
    sed 
    awk 

3.软件安装

    minicoda
    源代码
    二进制/jar

4. bash

    正则表达式
    条件:if,if else,if else嵌套
    循环:for,while

5.其他快捷操作命令

    查看空间大小:du/df
    权限:rwx,chrmod
    投递任务:nohup,sh,&,ctrl z,bg,fg,top,htop,ps-fx,kill-g
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