lncRNAdb:从文献中收集的已有功能注释的lncRNA数据库

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lncRNA的功能一直是研究的热点之一，随着高通量测序技术的发展，越来越多的lncRNA被识别，但是所有的lncRNA中，功能已知的lncRNA只是其中非常小的一部分。

为了更加方便的研究lncRNA的功能，科研工作者从文献中收集整理了有功能注释的lncRNA，并将相关信息整理成了数据库lncrnadb, 网址如下

http://www.lncrnadb.org/

在该数据中只保存了有功能注释的lncRNA，所以lncRNA的数据量是非常小的，以human为例，只有184条记录。

通过首页的检索框，可以方便的检索相关记录，示意如下

提供了两种检索方式，第一种检索方式支持根据lncRNA id, 功能，物种进行检索，第二种检索方式输入序列，然后和数据库中的lncRNA序列进行比对。

通过Set filter指定物种为homo sapiens, 然后直接检索就可以得到人类的所有lncRNA记录

点击每个lncRNA的记录，可以查看详细信息，以HAR1A为例，网址如下

http://www.lncrnadb.org/HAR1A/

相关结果很多，常用的有几下几种

1. 基本信息

包括lncRNA名称， 基本描述信息等，这里的别名非常有用，可以用于和其他lncRNA中的数据库进行对应

2. 在不同组织中的表达

给出相关的文献，示意如下

3. 保守性

4. 文献

5. 相互作用

6. 序列

该数据库中的内容是可以下载的，下载的格式为XML, 需要通过编程来解析，该网站也提供了API服务，具体用法可以参考官方的说明文档。

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