确认过眼神,TCGA甲基化分析工具再也没有更NB的了!
2019-04-06 本文已影响43人
医科研
作者:白介素2
谈起TCGA分析工具,我知道你肯定要说什么 GEPIA,cbioportal......, 但是 TCGA甲基化呢? 这些碉堡的神器瞬间就黯然失色了吧,数风流神器,还看白介素同学推荐,首先来看下今天要分享的神器有哪些 NB功能吧:
感兴趣的基因甲基化位点与预后的关系,生存曲线:
![](https://img.haomeiwen.com/i15721061/6a39da2a2488d7e0.png)
一键出图,甲基化分布情况:
![](https://img.haomeiwen.com/i15721061/f8e389699dc081b3.png)
超级酷的小提琴图,展示甲基化与感兴趣的临床表现之间的关系:
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高颜值图片全部可用直接下载,放到自己的paper中的,计算出 HR,提供一系列其它数据库的链接, genecards, COSMIC, GO数据库等。
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还可根据染色体选择分析:
![](https://img.haomeiwen.com/i15721061/498cfff49a97a3fe.png)
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分析感兴趣的基因甲基化在多肿瘤中的关系,随时出图 KM plot
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提供各种肿瘤中的 Top biomarker
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还有惊喜,超酷的热图免费送,自动出图,可以拿去发表了
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本科研神器还提供数据下载,即甲基化位点在TCGA肿瘤中的预后分析,单因素和多因素都有,且提供TCGA甲基化数据的矩阵数据,已经处理好了,拿来即用!
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好了,今天的内容就分享到这,想要这个神器嘛???
TCGA甲基化分析神器
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