生物信息学上游工具大集合
2022-11-07 本文已影响0人
可能性之兽
也许我应该试着有空的时候弄个域名，然后弄一个生信超级站点，彻底打通互联网的知识界限，不然那么多资源想找都要找很久，有些忘掉又很可惜
638 Free Single nucleotide polymorphism (SNP) Analysis Tools
104 Free Multiple Sequence Alignment (MSA) Tools
在生物信息学中，多序列比对是指多于两个 DNA、RNA 或蛋白质序列的比对，是计算生物学中最古老的问题之一。
一种常用的策略是最小化比对中的错配、插入和删除的数量，我们可以使用动态规划 (DP) 算法来计算最佳比对。
不幸的是，动态规划算法仅对少量序列在计算上是可行的；因此，DP 仅用于计算成对对齐。请参阅我们的在线工具 online tool，该工具计算两个序列之间可能的比对数。
多序列比对的目的可以是序列比较、数据质量评估、蛋白质和 RNA 结构预测、数据库搜索和系统发育分析。
158 Free Copy Number Variation (CNV) Analysis Tools
DNA拷贝数变异（CNV）是遗传变异的重要来源。阵列比较基因组杂交 (aCGH) 仍广泛用于 CNV 检测，但微阵列平台具有许多固有的局限性。
88 Free Whole Genome Assembly (WGA) Analysis Tools
此处涵盖了来自纠错、修剪、重叠群组装、脚手架和共识构建的基因组组装工具。该站点还包括组装评估工具和基因组特定区域的靶向组装。
78 Free Genotype Imputation Tools
564 Free RNA-seq and scRNA-seq Analysis Tools.
我们对与分析工作流程相关的 RNA-seq 工具进行了分类。因此，这也是 RNA-seq 工具的分类。
