作图

graph包:圆状网络图的绘制|互作网络图|基因通路网络图

2022-05-08  本文已影响0人  KS科研分享与服务

事情是这样的,有小伙伴给了一张图,是个GO与基因关系的网络图,问怎么做,因为是截图,所有这里我放自己做的图。是这样的:

640.png

为了鼓捣这个图也是费了一番功夫,这种网络图与ggtree这些是同源的感觉,是不过是曲线而已,主要是用ggraph包。重点在于构建作图数据。大类用大的节点,放在圆内部,周围一圈是节点,外部点的大小这里我用的是基因的P值,实际中可以用实际的数据。这个图的用处,我想到的有:(1)这种通络富集图,展示通路下包含的基因。(2)蛋白互作。(3)单细胞中每个细胞类群包含的亚群也可以用这个图展示。

很吊胃口吧!!!!
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