单细胞测序数据进阶分析—《细胞通讯》2.2CellChat多组别
2022-09-06 本文已影响0人
Biomamba生信基地
前言
在前面的一讲内容里(单细胞测序数据进阶分析—《细胞通讯》2.1CellChat基础分析教程)我们已经给大家介绍了CellChat单样本数据处理的实操。本讲的内容主要向大家展示如何挖掘细胞通讯在不同组别中的差异。本次课程所涉及的代码、测试文件在公众号后台中回复“CellChat多组别分析”获取。后续的代码如果不出意外都会在西柚云服务器中演示(做生信,如果你还在为电脑配置而烦恼。网址:西柚云生信共享服务器 )。
视频教程
单细胞测序数据进阶分析—《细胞通讯》2.2CellChat多组别分析
往期回顾
如果你还没学完基础课程,一定要跟着下面蓝色超链接的顺序走,每篇文章中的超链接要点开看(按顺序掌握自然没有疑问):
B站视频,先看一遍视频再去看推送操作,建议至少看三遍:
单细胞测序基础数据分析保姆级教程,代码部分整理在往期推送之中:
手把手教你做单细胞测序数据分析(六)——组间差异分析及可视化
上游fastq文件处理:
单细胞分析的最上游——处理Fastq文件:cellranger
单细胞分析的最上游——处理Fastq文件:dropseqRunner
细胞通讯
B站连续播放起来比较方便:
https://www.bilibili.com/video/BV1Ab4y1W7qx?p=1
往期推送
单细胞测序数据进阶分析—《细胞通讯》2.1CellChat基础分析教程
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答读者问(十一)如何一次性读取一个目录下的cellranger输出文件?
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