如何寻找基因的启动子——NCBI版

原创 如期生物

之前给大家介绍了如何使用UCSC数据查找基因的启动子；今天再给各位科普一下如果通过“NCBI”数据库，查找基因的启动子。这次还是以“FAU”为例进行介绍哈：

网址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

1.打开网址，如下图在下拉菜单栏选择Gene，在搜索框输入感兴趣的基因及物种，点击search

2.根据目的基因及物种信息单击搜索结果栏中的目的基因名称（注意：检索的结果除了目标物种外还会有其他物种的基因信息，所以选择时注意确认红色圈内的物种及基因信息）

3.进入目的基因的信息页面后，下拉到“Genomic regions, transcrips, and products”信息栏，并点击FASTA:

4.页面跳转至基因序列新页面（此次重点关注右上角基因位置信息栏，它显示的是转录本在基因组上的位置信息），如下图：

5.一般默认基因上游2000 bases为该基因的promoter区域，调整右上角位置数值：如FAU的转录本序列在基因组上对应的位置是在"65120630~65122134",我们需要把它更改为（65118629~65120629），点击Update View；结果如下，右侧的2000bp核酸序列即为启动子序列：

注意：利用数据库查找的启动子都是一个预测的大致结果，不是准确启动子序列；如果想得到准确的启动子序列，需要进一步进行实验确认。