02.R语言基础变量讲解

变量

向量Vector

> a=c(1,2,3)
> class(a)  #判断向量的类型
[1] "numeric"

一般不需要判断向量的类型，只有在函数不能运行时，判断一下是不是数据类型不复合函数要求

> a=c(1,"a",2)
> class(a)
[1] "character"

创建向量时如果有数字，也有字符，就会全部变成字符

> a=1:10
> a
 [1]  1  2  3  4  5  6  7  8  9 10
> a=seq(1:10)
> a
 [1]  1  2  3  4  5  6  7  8  9 10

左侧的a是变量，用来存储=右侧的操作;
操作数字"numeric"不用加"";
操作字符串"character"要加""
一般' '与" "无区别, 除非操作对象本身带一个单引号'

矩阵型（Matrix）和数组型（Array）

矩阵Matrix=向量Vector+维度Dim

> a=(1:10)
> a
 [1]  1  2  3  4  5  6  7  8  9 10
> dim(a)=c(2,5)
> a
     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,]    1    3    5    7    9
[2,]    2    4    6    8   10
> class(a)
[1] "matrix" "array" 

a

> pheatmap::pheatmap(a)

Rplot.png

> a[2,3] #在a中取元素：第2行,第3列
[1] 6 #数字型6
> a[2,3] <- "6" #给第二行,第三列赋值，赋值为字符
> a
     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,] "1"  "3"  "5"  "7"  "9" 
[2,] "2"  "4"  "6"  "8"  "10"
> pheatmap::pheatmap(a)
Error in cut.default(x, breaks = breaks, include.lowest = T) : 
  'x' 必需是数值
> class(a)
[1] "matrix" "array" 
> str(a)
 chr [1:2, 1:5] "1" "2" "3" "4" "5" "6" "7" "8" "9" "10"

赋值后数据类型变化

取元素

1. 通过下标来取
2. 通过逻辑符取

数组是多维的，使用较少，忽略

数据框（Data Frame）

>is. #判断对象类型
>as. #改变对象类型
> a=c(1:10)
> dim(a)=c(2,5)
> a
     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,]    1    3    5    7    9
[2,]    2    4    6    8   10
> is.matrix(a)
[1] TRUE
> is.array(a)
[1] TRUE
> is.data.frame(a)
[1] FALSE
> b <- as.data.frame(a)
> b
  V1 V2 V3 V4 V5
1  1  3  5  7  9
2  2  4  6  8 10
> class(b)
[1] "data.frame"
> str(b)
'data.frame':   2 obs. of  5 variables:
 $ V1: int  1 2
 $ V2: int  3 4
 $ V3: int  5 6
 $ V4: int  7 8
 $ V5: int  9 10
> pheatmap::pheatmap(b)

b热图 比较a,b的数据类型

> b[2,5] <- "10"
> class(b)
[1] "data.frame"
> str(b)
'data.frame':   2 obs. of  5 variables:
 $ V1: int  1 2
 $ V2: int  3 4
 $ V3: int  5 6
 $ V4: int  7 8
 $ V5: chr  "9" "10"
> pheatmap::pheatmap(b)
Error in cut.default(x, breaks = breaks, include.lowest = T) : 
  'x' 必需是数值

P2 13:23-15:35 针对线下讲怎么复制代码、提问; 如果是线上的，只对如何梳理代码有点帮助

列表型（List）

d=options()

d是一个有95个元素的列表

R可以深度定制，可以自己修改成很多个性化配置

d$repos #选取列表中的元素
e=d$repos #只有在数据框和列表中可以用$
View(e)

屏幕截图 2022-03-12 124316.png

取元素

1. 通过下标来取
2. 通过逻辑符取

> b[,3]
[1] 5 6
> b[,c(T,T,F,F,T)]
  V1 V2 V5
1  1  3  9
2  2  4 10

上述代码是指示例作用，真正处理大数据时，应该用Ture or False来取

grep('RNA-seq', a$Assay_Type)
#grep是一个搜索函数，搜索第一个参数RNA-seq，在第二个参数里面搜索a$Assay_Type：a的Assay_Type列；返回RNA-seq的位置

grepl('RNA-seq', a$Assay_Type)
#返回每一个位置（行数）的Ture or False

index1=grep('RNA-seq', a$Assay_Type)
index2=grepl('RNA-seq', a$Assay_Type) #赋值
e=a[index1,]
e=a[index2,]
#两种方法均可以

tmp#小的数据框

list用[]索引之后依然是list,可以理解为子list, 用[[]]才可以索引到元素本身