下载line1序列
2018-11-08 本文已影响33人
苏牧传媒
法一：
安装：
sudo apt install mysql-client-core-5.7
sudo apt install mariadb-client-core-10.1
下载：
mysql --user=genome --host=genome-mysql.cse.ucsc.edu -A -D mm10 -e 'select chrom,chromStart,chromEnd,name from nestedRepeats where repClass="LINE" ' > line1.bed
查看：
ref: https://www.biostars.org/p/127759/
法二：
查看：
ref：UCSC Genome Browser Public Support › LINE
比较下选择第二个mm10：
验证：
