GO富集分析四种风格展示结果—柱形图，气泡图

前面给大家简单介绍过☞什么是Gene Ontology(GO)，以及如何用一些简单易用的网页工具去做GO和KEGG富集分析

☞富集分析DAVID、Metascape、Enrichr、ClueGO

☞比DAVID强一万倍的基因注释工具

☞GO，KEGG富集分析工具——DAVID

也给大家简单的介绍过如何用R做GO富集分析，以及如何将富集结果中的gene ID转成基因名字

☞GO和KEGG富集结果如何显示基因symbol

还有计算富集倍数的三种方法

☞GO和KEGG富集倍数（Fold Enrichment）如何计算、

今天我们来聊聊怎么来展示GO富集分析的结果，下面是一个GO富集分析的结果表。

ONTOLOGY：区分是BP，MF还是CC
ID：具体的GO条目的ID号
Description：GO条目的描述
GeneRatio：这里是一个分数，分子是富集到这个GO条目上的gene的数目，
            分母是所有输入的做富集分析的gene的数目，可以是差异表达
            分析得到的gene
BgRatio：Background Ratio. 这里也是一个分数，分母是人的所有编码蛋白的
        基因中有GO注释的gene的数目，这里是19623个，分子是这19623个
        gene中注释到这个GO条目上面的gene的数目
pvalue：富集的p值
p.adjust：校正之后的p值
qvalue：q值
geneID：输入的做富集分析的gene中富集到这个GO条目上面的具体的
        gene名字
Count：输入的做富集分析的gene中富集到这个GO条目上面的gene的数目

我们知道GO富集分析的结果又可以进一步划分成三个类。

BP:biological process,生物学过程。
MF:molecular function,分子功能。
CC:cellular component, 细胞成分。

因此在画图的时候，我们需要将这三类给区分开来。下面我们分别用了四种不同的方式来展示GO富集分析的结果。

1.气泡图分三个框显示BP,MF和CC的富集分析结果

2. 柱形图分三个框显示BP,MF和CC的富集分析结果

3. 柱形图用三种不同颜色显示BP,MF和CC的富集分析结果

4. 气泡图+标签，显示BP,MF和CC的富集分析结果

这张图的横轴是富集倍数（fold enrichment），计算方法如下

fold enrichment = GeneRatio / BgRatio

上面四张图的横坐标分别为GeneRatio，Count，−log10(p.adjust)和Fold enrichment。

☞完整的GO/KEGG富集分析及绘图代码的视频讲解

GO富集分析四种风格展示结果—柱形图，气泡图