R语言与生信应用13-R语法-R文件操作1
2019-04-30 本文已影响60人
BioSi
R文件操作1
获取数据的方式
- 利用键盘输入数据
- 读取存储在磁盘上的数据文件
- 通过开放数据库连接（ODBC, Open database Connectivity）访问数据库系统来获取数据(RODBC包)
键盘输入数据（数据量较少时）
# 可以使用scan函数一个个输入来创建向量
> patientID <- scan()
1: 1
2: 2
3: 3
4: 4
5:
Read 4 items
# 也可以直接使用c()函数创建向量，结果是相同的
> patientID <- c(1, 2, 3, 4)
> admdate <- c("10/15/2009", "11/01/2009", "10/21/2009", "10/28/2009")
> age <- c(25, 34, 28, 52)
> diabetes <- c("Type1", "Type2", "Type1", "Type1")
> status <- c("Poor", "Improved", "Excellent", "Poor")
> data <- data.frame(patientID, age, diabetes, status)
> data
patientID age diabetes status
1 1 25 Type1 Poor
2 2 34 Type2 Improved
3 3 28 Type1 Excellent
4 4 52 Type1 Poor
data2 <- data.frame(patientID=character(0), age=numeric(0), diabetes=character(), status=character())
# 使用edit和fix函数来添加数据
> data2 <- edit(data2)
> fix(data2)
其他R编辑数据的函数，用法与edit和fix类似
vi(name = NULL, file = "")
emacs(name = NULL, file = "")
pico(name = NULL, file = "")
xemacs(name = NULL, file = "")
xedit(name = NULL, file = "")
课程分享
生信技能树全球公益巡讲
（https://mp.weixin.qq.com/s/E9ykuIbc-2Ja9HOY0bn_6g）
B站公益74小时生信工程师教学视频合辑
（https://mp.weixin.qq.com/s/IyFK7l_WBAiUgqQi8O7Hxw）
招学徒：
（https://mp.weixin.qq.com/s/KgbilzXnFjbKKunuw7NVfw）
