单细胞36计之10笑里藏刀---使用CellSelector自动
2021-04-01 本文已影响0人
Seurat_Satija
第十计 笑里藏刀
比喻外表和气而内心阴险。
除了返回单元格名称的向量外，CellSelector()还可以获取所选单元格并为其分配新的标识，返回具有已设置标识类的Seurat对象。这是通过将用于制作图的Seurat对象CellSelector()`以及一个identity类传递给此对象的。例如，我们将选择与之前相同的一组单元格，并将其标识类设置为“ selected”
pbmc3k.final <- CellSelector(plot = plot, object = pbmc3k.final, ident = "selected")
image
levels(pbmc3k.final)
## [1] "selected" "Naive CD4 T" "Memory CD4 T" "CD14+ Mono" "B"
## [6] "CD8 T" "FCGR3A+ Mono" "NK" "Platelet"
