读《来自基因组的一些数学》

本书是郝柏林老师（1934年6月26日—2018年3月7日）在生物信息学领域工作的一些思考，郝先生是著名的理论物理学家，在六十几岁（1997）转向理论生命科学领域研究，而且在这两个领域都著作颇丰。就拿生命科学这块来说吧，不仅有今天我们聊的《来自基因组的一些数学》，还有《生物信息学手册》这样教科书级别的书籍。

人们常说异域风情，带着理论物理的眼光再看高通量测序时代的生命科学，在郝先生的笔下，我们看到ATCG看似自由的组合中蕴含的接近苛刻的次序。可谓是，有着凛冽的美。

本书所言基因组，乃是人类基因组计划之后，基于NGS技术人类得以测量的包括人类在内的各物种的基因组。在上个世纪，郝先生就在书中提到高通量测序会改变生命科学的研究范式：从证伪到大数据。在本书的前言中：

其实这一论断，放在今天仍然不算过时，就算是【科学工作者很少有时间去思考更深层次的问题】这一现象也是一样。

同样地，对我们做单细胞数据分析的朋友来说，当然是遇到了好时候。但是后面的【力争全局在胸，坚持单刀直入。入门是不难的，深入也是办得到的，但是“找到感觉”是不容易的】这一描述是数据分析过程的一个缩影。

本书的轮廓是，希望在全局上研究基因组，面向整个基因组试图提出之前人们没有，或者解决不了的问题。如，如何刻画特定的基因组，如何预测一个新基因，某个物种的基因组序列有没有特定的序列？这些问题的提出，给人一种豁然开朗的感觉，就像一直都在低头拉车，突然有位老者提醒你：小伙子，抬头看看天上半明半暗的云。