fasta文处理

2022-05-21  本文已影响0人  纵纵纵小鸮

1.fastq 转fasta文件:

awk '{if(NR%4 == 1){print ">" substr($0, 2)}}{if(NR%4 == 2){print}}' xx.fastq >xx.fasta

2.对压缩的fq.gz计数:

zcat *fq.gz | wc -l 

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