fasta文处理
2022-05-21 本文已影响0人
纵纵纵小鸮
1.fastq 转fasta文件:
awk '{if(NR%4 == 1){print ">" substr($0, 2)}}{if(NR%4 == 2){print}}' xx.fastq >xx.fasta
2.对压缩的fq.gz计数:
zcat *fq.gz | wc -l
1.fastq 转fasta文件:
awk '{if(NR%4 == 1){print ">" substr($0, 2)}}{if(NR%4 == 2){print}}' xx.fastq >xx.fasta
2.对压缩的fq.gz计数:
zcat *fq.gz | wc -l