学习任务：学习R包

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1. 检查镜像

• 检查CRAN镜像是否配置完成：options()$repos

  
  

2.在Rstudio中设置自定义CRAN和Bioconductor的下载镜像

 # options函数就是设置R运行过程中的一些选项设置
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #对应清华源
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #对应中科大源
# 当然可以换成其他地区的镜像

• 设置好之后可以通过：options()$BioC_mirror来检测

  
  

如果还是有问题，点开这个

3. R包的安装命令

install.packages(“包”)
BiocManager::install(“包”)

4. R包的加载命令

library(包)
require(包)

5. 安装dplyr包

安装成功

• mutate(),新增列

  
  
• select(),按列筛选
• filter()筛选行
• arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序
• summarise()：汇总

6.dplyr两个实用技能

• 管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)
• count统计某列的unique值

7.dplyr处理关系数据

即将2个表进行连接，注意：不要引入factor

• 內连inner_join,取交集
• 左连left_join
• 全连full_join
• 半连接：返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join
• 反连接：返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join
• 简单合并