校验md5的方法

由于硬盘在运输过程会出现碰撞，震荡等问题，或者网盘下载的数据，都有可能造成数据损坏，所以在收到数据后，应该第一时间对数据的完整性进行验证，这里使用md5sum 进行校验。

在数据传输前，也应该对数据进行生成MD5值
md5sum *.fastq >md5.txt

linux校验方法：md5sum -c md5.txt

小技巧：
如果是有很多文件目录下存放的mdMD5，那么
像这样

image.png

一行命令：

ls ./*/*.txt |while read line;do name=`ls $line|awk -F '/' '{print$2}'`;echo "cd $name && md5sum -c MD5* && cd ..";done |sh

windows校验方法：

下载cygwin，使用md5sum.exe -c md5.txt进行校验。

sha256sum

另一种校验的方式是sha256sum,比如常见的gatk 的一些database都是用sha256校验的。用法：
sha256sum xxx.tar.gz
sha256sum -c xxx.sha256