批量提取文件前缀

• 进入文件所在目录

cd /public/jychu/chicken_body_size/fastq/dulong_10

• 提取我们所需要的所有文件

find *_1.fastq.gz >sample

(base) [jychu@localhost dulong_10]$ cat sample
SRR9967586_1.fastq.gz
SRR9967587_1.fastq.gz
SRR9967588_1.fastq.gz
SRR9967589_1.fastq.gz
SRR9967590_1.fastq.gz
SRR9967591_1.fastq.gz
SRR9967592_1.fastq.gz
SRR9967593_1.fastq.gz
SRR9967594_1.fastq.gz
SRR9970467_1.fastq.gz

• 在sample文件里修改所有文件名

sed -i "s/_1.fastq.gz/ /g"  sample

结果如下

(base) [jychu@localhost dulong_10]$ cat sample
SRR9967586
SRR9967587
SRR9967588
SRR9967589
SRR9967590
SRR9967591
SRR9967592
SRR9967593
SRR9967594
SRR9970467

• 另一种方法

ls *.fastq.gz | cut -d"." | cut -f1 > sample