2021-06-05 前列腺癌可变剪接系统分析
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NAome
可变剪接的存在不仅仅是拓展了转录组与翻译组,其异常也会带来致命的问题,诸如肿瘤,代谢类疾病等。今天分享的这项研究聚焦与前列腺癌中的可变剪接异常,算是系统研究特定癌种中可变剪接的一个比较完整的“范例”。
三言两语
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基于各种公共数据库中的转录组数据,研究者系统分析了前列腺癌中的可变剪接异常情况,尤其关注原位癌与转移癌以及临床治疗后的可变剪切变化情况。结果表明,相比于癌旁组织,原位癌,转移癌中可变剪接增多,尤其是内含子保留事件。并且可变剪接异常与前列腺癌的发生发展密切相关。
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从转录调控与基因组变异两个层面分析,前列腺癌可变剪接事件增加的可能原因。结果显示,剪接相关调控因子的基因组变异是造成前列腺癌中可变剪接异常的主要原因。
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鉴于可变剪接事件在前列腺癌中的重要地位,研究者探讨了靶向剪接体的前列腺癌治疗策略。
Reference
Zhang, D. et al. Intron retention is a hallmark and spliceosome represents a therapeutic vulnerability in aggressive prostate cancer. Nat Commun 11, 2089 (2020).