Conserved score的计算/Conserved Ele

2023-10-12  本文已影响0人  深山夕照深秋雨OvO

https://academic.oup.com/bioinformatics/article/35/13/2320/5210871
或者
https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty966

在线网站版, 突出一个简单
当然本质上依然还是phastCons和phyloP


http://compgen.cshl.edu/phast/phastCons-HOWTO.html
一个教程


https://biochen.org/cn/blog/2021/%E5%A2%9E%E5%BC%BA%E7%89%88%E4%B8%A4%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E7%BB%84%E6%AF%94%E5%AF%B9/
https://biochen.org/cn/blog/2021/%E5%A4%9A%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E7%BB%84%E6%AF%94%E5%AF%B9/
获取maf文件

https://biochen.org/cn/blog/2021/%E4%BD%BF%E7%94%A8PHAST%E5%88%86%E6%9E%90%E4%BF%9D%E5%AE%88%E6%80%A7/
鉴定CE

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