R语言

1.下载R和Rstudio

2.R语言的基本操作

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1画图

plot是图，rnorm是正态分布的函数
plot(rnorm(50))点状图

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boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))箱线图
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iris是R语言自带的数据库，iris$Sepal.Length表示iris数据框的Sepal.Length这一列数据

2 R语言工作目录

引自生信星球
R语言只能在一个文件夹下进行工作
设置工作目录：setwd()
查看工作目录：getwd()
可以用project建立多个工作目录

• 打开Rstudio，

  
  
  

  project是绑定文件夹的。弹出的窗口问你是新建一个文件夹还是使用已经存在的文件夹。我们以新建为例：

  
  
  
  
  

  填好文件夹名后，（其实给文件夹命名了，也就等于给project命名了，二者同名）点击Create Project，就打开了一个新的session，不干扰你目前正在进行的项目噢。

• 2.打开Rproject
  生信技能树创始人jimmy推荐，只用这一个方法打开Rstudio。那么下次再要打开这个项目时，只需要在文件夹中找到这个R project，双击打开即可。
  从此管理多个项目不成问题咯。
  

  打开这个项目后，用getwd()查看一下，就会发现你的工作目录就是Rproject所在的目录啦。
  你用到的同一个项目的脚本/数据全都默认放在这里。

3 R语言操作

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1.安装包，install.packages(“包”)
2.下载好安装包，在本地安装tool-install packages
3.Bioconductor进行安装

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总结