Day36-Rosalind练习题学习（2）

    又来做Rosalind题目啦~

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2.Counting DNA Nucleotides

    这题也比较简单，就是给出一段DNA序列，将它翻译成RNA，本质上也就是将T碱基替换成U碱基。

Question 2
    python里面也有一个特殊的方法replace()可以对字符串中的子字符串进行替换，直接在命令行中执行即可。

>>> str="GATGGAACTTGACTACGTAAATT"
>>> print(str.replace("T","U"))
GAUGGAACUUGACUACGUAAAUU

    这题好像没有看到什么特殊的解法。

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3.Complementing a Strand of DNA

    给出一个DNA序列，需要打印出其互补链上的序列，本质上实际上是字符串倒置加上替换的一个操作。

Question 3
    这里需要用到python中一个反向输出字符串的小技巧seq[::-1]能够将seq非常方便地倒置，再加上上面介绍的replace()，可以很轻松地完成需求。

>>> s="AAAACCCGGT"
>>> print(s[::-1].replace("A","M").replace("C","N").replace("T","A").replace("G","C").replace("M","T").replace("N","G"))
ACCGGGTTTT

    我这里替换使用了临时替代“M”“N”，还看到了一种写法是利用大小写的不同，最后用upper()转换大小写，这样会比我少写两个replace()，比较巧妙。

seq = 'AAAACCCGGT'
rev_seq=seq[::-1].replace('C', 'g').replace('G', 'c').replace('T', 'a').replace('A', 't').upper()
print(rev_seq)