R之Bayes分析-很烂的使用说明

*仅供实验室内部使用，文中所提到的文件在实验室电脑上“贝叶斯检验”文件夹下

一、安装R

安装

或到官网下载最新版本：

https://www.r-project.org/

二、安装Package

需要安装‘BayesFactor’ package和它的Depends packages（详见BayesFactor.pdf）

这几个在packages文件夹下都有，也可去网上下载最新版。

https://cran.r-project.org/web/packages/BayesFactor/index.html

怎么安装的我实在是想不起来了，大概是在R里运行下这个：

install.packages('BayesFactor')

*先install Depends的 coda、knitr、markdown，最后再install BayesFactor

安装后运行：

library(BayesFactor)

没有报错应该就是可以的，报错有时候是操作问题（安装顺序等问题），有时候可能是电脑的问题，可以换电脑试下。

三、计算BayesFactor

官方说明见：贝叶斯检验\BayesFactor\doc\index.html

代码参考：贝叶斯检验\检验结果\bfANOVA.docx

建议先做方差分析/t检验，和spss的统计结果比对是否一致，一致的话再继续计算BayesFactor。

数据的录入我是采用的最原始的方法，直接输进去的（当然所谓直接输进去不是一个一个敲进去，是用excel转换格式粘进去的）

对BayesFactor值的解释建议看文件夹里面的文献。

大约是：计算出的BayesFactor= 备择假设为真的概率/零假设为真的概率。文献中一般会取倒数反过来报告。倒数一般大概需要接近或大于3才比较有利于支持零假设。

2016.9.11