基因注释与功能分类（2）

京都基因与基因组百科全书

KEGG(京都基因与基因组百科全书)是基因组破译方面的数据库。在后基因时代一个重大挑战是如何使细胞和有机体在计算机上完整的表达和演绎，让计算机利用基因信息对更高层次和更复杂细胞活动和生物体行为作出计算推测。为达到此目的，人们建立了一个在相关知识基础上的网络推测计算工具。在给出染色体中一套完整的基因的情况下，它可以对蛋白质交互（互动）网络在各种细胞活动起的作用作出预测。 KEGG 的PATHWAY 数据库整合当前在分子互动网络（比如通道，联合体）的知识，KEGG 的GENES/SSDB/KO 数据库提供关于在基因组计划中发现的基因和蛋白质的相关知识，KEGG 的COMPOUND/GLYCAN/REACTION数据库提供生化复合物及反应方面的知识。

KEGG 是了解高级功能和生物系统（如细胞、 生物和生态系统），从分子水平信息，尤其是大型分子数据集生成的基因组测序和其他高通量实验技术的实用程序数据库资源， 由日本京都大学生物信息学中心的Kanehisa实验室于1995年建立。是国际最常用的生物信息数据库之一，以“理解生物系统的高级功能和实用程序资源库”著称。

网站链接：KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes

KEGG目前共包含了19个子数据库，它们被分类成系统信息、基因组信息和化学信息三个类别 。

基因组信息存储在GENES数据库里，包括全部完整的基因组序列和部分测序的基因组序列，并伴有实时更新的基因相关功能的注释。
KEGG中化学信息的6个数据库被称为KEGG LIGAND数据库，包含化学物质、酶分子、酶化反应等信息。KEGG BRITE数据库是一个包含多个生物学对象的基于功能进行等级划分的本体论数据库，它包括分子、细胞、物种、疾病、药物、以及它们之间的关系。
一些小的通路模块被存储在MODULE数据库中，该数据库还存储了其他的一些相关功能的模块以及化合物信息。
KEGG DRUG数据库存储了目前在日本所有非处方药和美国的大部分处方药品。
KEGG DISEASE是一个存储疾病基因、通路、药物、以及疾病诊断标记等信息的新型数据库。