一、从NCBI中下载SRA数据 | 转录组上游分析教程系列
2022-03-08 本文已影响0人
小杜的生信筆記
前言:
我发现有些童鞋在回复关键词时,如果没有得到对应的回复内容,也许是你输入的关键词错误了,请你重新输入即可。我这里都是按进准匹配进行回复的,目前主要是按我发内容的时间作为“关键词”,如今天“20220308”,8个数字。
上一期转录组上游分析教程系列 | 从NCBI下载SRA数据开启了2个微豆的付费(1元=7个微豆),结果正没有老铁支持。应该是自己的内容不好导致的。因此,后续还是继续分享吧。也感谢,下面8位老铁的支持哦!本期的电子版可以私下我,发送给你们,如果需要。
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## 安装 lftp
conda install -y lftp
(base)PowerEdge-R840:~$ conda install -y lftp
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: done
==> WARNING: A newer version of conda exists. <==
current version: 4.8.3
latest version: 4.11.0
Please update conda by running
$ conda update -n base conda
## Package Plan ##
environment location: /home/data/ssy10/miniconda2
added / updated specs:
- lftp
The following packages will be downloaded:
package | build
---------------------------|-----------------
gettext-0.19.8.1 | h0b5b191_1005 3.6 MB conda-forge
lftp-4.9.2 | h87db986_0 6.4 MB conda-forge
------------------------------------------------------------
Total: 10.0 MB
The following NEW packages will be INSTALLED:
gettext conda-forge/linux-64::gettext-0.19.8.1-h0b5b191_1005
lftp conda-forge/linux-64::lftp-4.9.2-h87db986_0
libiconv conda-forge/linux-64::libiconv-1.16-h516909a_0
Downloading and Extracting Packages
lftp-4.9.2 | 6.4 MB | ################################################## | 100%
gettext-0.19.8.1 | 3.6 MB | ################################################## | 100%
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done
1.1.1 lftp的操作使用
在 lftp 配置文件 ~/.lftp/rc 中设置 pget 使用的线程数
set pget:default -n 10
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