生信学习笔记Day4
2020-03-25 本文已影响0人
yhh_hygge
一.认识R和Rstudio
- R是一种编程语言,也是统计计算和绘图的环境,它汇集了许多函数,能够提供强大的功能。
- R语言软件界面简陋,通常不直接使用,而是用图形界面的Rstudio。
-
RStudio是免费提供的开源集成开发环境(IDE)。RStudio提供了一个具有很多功能的环境,使R更容易使用,是在终端中使用R的绝佳选择。
俺的Rstudio界面
作图说简单也简单,只需要知道图的名字,知道用的什么R包即可自行探索;说难也难,别人的代码套在自己的数据上,需要一定的R语言功底和解决报错的能力。——生信星球
- 这话说的是实话,所以一个良好的编程功底才是成为一个计算生物学家的前提,不然永远就在实验生物学家背后跟着吧!
二.设置字体大小
某种意义上,这一步很重要,不然像我这种老年兔,看一会电脑,眼睛就花的不行。
字体设置
三.R语言基本操作
1.用Rproject管理工作目录
所谓工作目录就是默认的读取和储存位置,也就是说,R语言只能和一个文件夹进行互动,这个文件夹非常重要,做不好就会导致你的脚本、文件、图片各种乱跑,找不到。——生信星球
- 养成良好习惯,从我做起。
正常情况下关于工作目录的介绍是:
- 设置工作目录:setwd()
- 查看工作目录:getwd()
2.显示文件列表
dir()
list.files()
3.加减乘除
sqrt() #开根号
log10(100)#结果为2
4.赋值
赋值符号用<-
,这是小于号加上减号,也可以按Alt加上减号
5.删除变量
rm(x)
6.列出历史命令
history()
相当于鼠标单击右上角的history标签
当你双击某个命令,他就会跳到你的控制台大于号后面了,可以修改后运行。
7.清空控制台
ctrl+1