2022-11-30 seurat如何复现文章数据
2022-11-30 本文已影响0人
kke_wang
- 从文章中下载的数据往往是一个表达矩阵和metadata.txt，如何使用这两个数据呢？
- 读入表达矩阵，创建seurat对象
nature<-readRDS("counts.Rds")
nature <- CreateSeuratObject(counts = nature,min.cells = 3, min.features = 200) - 添加metadata
meta<-read.table("meta.txt")
nature=AddMetaData(nature,metadata = meta)
如果要删除某一列metadata，则
nature@metadata$cell_type = NULL
