Sample Type Codes for TCGA
2020-05-25 本文已影响0人
找兔子的小萝卜
image.png
根据样本ID的第14-15位，给样本分组（tumor和normal）
table(str_sub(colnames(exp),14,15))
#>
#> 01 11
#> 36 9
image.png
上述表格为14-15位对应的数字，为第一列，然后对应的数字的含义为后面描述。
我所下载的卵巢癌数据的结果为：
image.png
就是说：卵巢癌中只有原发性的实体肿瘤与复发性实体肿瘤而没有对照组。
样本信息及其代码储存在：C:\Users\pingw\Documents\R课件与作业\TCGA\tcga_1
