文献分享---乳腺癌复发肺转移的空间多组学分析
2025-04-23 本文已影响0人
单细胞空间交响乐
作者，Evil Genius
今天我们分享文献，虽然IF不高，但是很多分析方法很好。
知识积累
原发性乳腺癌（BC）和转移性肿瘤具有不同的肿瘤微环境（TME）生态系统。
在临床上，BC分为三种亚型：管腔型（ER+，PR+/-）、HER 2过表达（HER2+，ER+/-，PR+/-）和三阴性乳腺癌（TNBC; ER-，PR-，HER2-），每种亚型表现出不同的复发时间和诊断后的器官嗜性。mBC（转移性乳腺癌）的治疗策略具有共性，但根据亚型和转移部位而有所不同。
肿瘤微环境（TME）的异质性对有效的BC治疗提出了挑战，肿瘤细胞与TME内其他细胞成分之间的相互作用显著影响癌症的治疗效果。
IMC + scRNA + Spatial。
结果1、配对CT肺转移瘤的单细胞空间分析
通过IMC分析说明了原发性BC和肺转移瘤之间TME组分的差异.
结果2、细胞邻域和细胞相互作用/回避分析揭示了器官特异性免疫空间拓扑结构
TME的空间结构在肿瘤转移和治疗反应中起着至关重要的作用。
将CN定义为距离中心细胞最近的20个细胞。
利用基于IMC的高级空间分析，确定了不同的细胞中心，揭示了原发部位和肺转移之间的器官特异性特性。
结果3、与原发性BC相比，BC肺转移显示more exhausted TME。
对原发性乳腺肿瘤和肺转移瘤中关键T细胞调节因子的表达模式进行了研究。
与BC相比，肺转移瘤中TME耗竭，尤其是在三阴性亚型中。mIF染色和空间分析进一步证实了HLA-DR+上皮细胞和内皮细胞之间的重要细胞网络。
结果4、配对空间分辨蛋白质组学分析揭示了BC肺转移的潜在生物学机制
结果5、WGCNA显示了与空间TME组分相关的丰富分子特征
结果6、BC肺转移的snRandom-Seq分析
方法分析重要的是
