Day 10 多任务并行投递
2018-12-19 本文已影响0人
陈宇乔
多任务并行投递:
第一步
vim trim_galore.sh
cat $1 |while read id
do
arr=(${id})
fq1=${arr[0]}
fq2=${arr[1]}
# echo $fq1 $fq2
echo "trim_galore --phred33 -q 25 -e 0.1 --length 36 --stringency 3 --paired -o ./ $fq1 $fq2"
done
第二步
bash trim_galore.sh config >tmp ###############config 为病人的ID号
image.png
image.png
第三步
split -l 2 tmp #######默认生成xaa,xab
ll -trh
image.png
第四步 分别bash xaa xab就可以
nohup bash xaa &
nohup bash xab &