ggplot误差棒添加
参考自《R Graphics Cookbook》
本文针对ggplot2添加误差棒的一种方法：使用geom_errorbar()语法
library(ggplot2)
library(gcookbook)
library(dplyr)
一、柱形图加误差棒
#筛选部分数据来作图
ce_mod <- cabbage_exp %>%
filter(Cultivar == "c39")
ce_mod
#制图
ggplot(ce_mod, aes(x = Date, y = Weight)) +
geom_col(fill = "white", colour = "black") +
geom_errorbar(aes(ymin = Weight - se, ymax = Weight + se),
width = 0.2)
二、折线图加误差棒
#制图
ggplot(ce_mod, aes(x = Date, y = Weight )) +
geom_line(aes(group = 1)) +
geom_point(size = 4) +
geom_errorbar(aes(ymin = Weight - se, ymax = Weight + se),
width = 0.2)
三、对于分组的柱形图加误差线：
分组数据添加误差线与分组的柱形图的原理相同，都需告知ggplot2其组内成员的位置为分开并列排放的，否则为上下堆砌样式；即position = "dodge"
3、1 对分组柱形图 不 添加position = "dodge"的误差棒效果：上下堆砌的
#制图
ggplot(cabbage_exp, aes(x = Date, y = Weight, fill = Cultivar)) +
geom_col(position = "dodge") +
geom_errorbar(aes(ymin = Weight - se, ymax = Weight + se),
width = .2, size =2)
3.2 对分组柱形图添加position = "dodge"的误差棒效果：组内左右排列的
#制图
ggplot(cabbage_exp, aes(x = Date, y = Weight, fill = Cultivar)) +
geom_col(position = "dodge") +
geom_errorbar(aes(ymin = Weight - se, ymax = Weight + se),
position = "dodge", width = .2, size =2)
#可以发现组内的误差棒不再堆砌，而是两个左右组成一组，同时其顶端各自的宽度都变短了(应该是两个加起来的width是原来的一个)
3.3
问题来了，上图的误差棒虽然左右分组了，但是默认贴在一起的，那么此时要让误差棒组内并列的dodge参数与柱形图组内的一致;
柱形图的dodge默认是0.9, 因此二者须一致，误差棒才能显示在柱形图的中间位置
ggplot(cabbage_exp, aes(x = Date, y = Weight, fill = Cultivar)) +
geom_col(position = "dodge") +
geom_errorbar(aes(ymin = Weight - se, ymax = Weight + se),
position = position_dodge(0.9), width = .2)
#注意：position = "dodge"是position = position_dodge()的简写，但若要涉及到调整具体参数则必须全写
四、对于分组的折线图加误差棒：
而对于分组的折线图来说，往往是形成n条折线，而实际上这些折线通常在x轴上可以算作是堆积的；
因此也可以通过position_dodge语言设置其组内的位置是否分开
4.1 通常是组内不分开的，即堆积的，也就是dodge为0
#首先设置一个整体的dodge值，应用到点、线、误差棒，三者要一致
pd <- position_dodge(0)
#制图
ggplot(cabbage_exp, aes(x = Date, y = Weight,
#注意设置group告知分组
colour = Cultivar, group = Cultivar)) +
geom_errorbar(aes(ymin = Weight - se, ymax = Weight + se),
width = 0.2, size = 1,
colour = "black", position = pd) +
geom_line(position = pd, size = 1) +
geom_point(position = pd, size = 4)
4.2 左右分开的，即dodge为不为0，值越大，组内元素的距离会越远
pd <- position_dodge(0.5)
#制图
ggplot(cabbage_exp, aes(x = Date, y = Weight,
colour = Cultivar, group = Cultivar)) +
geom_errorbar(aes(ymin = Weight - se, ymax = Weight + se),
width = 0.2, size = 1,
colour = "black", position = pd) +
geom_line(position = pd, size = 1) +
geom_point(position = pd, size = 4)
五、注意
离散型变量被映射到colour和fill的图形属性时(如柱形图)，此变量默认即为分组变量；但在误差线的例子中需要用group语法手动告知ggplot2分组分组。
误差棒的语法一般要先写，否则会遮盖其他更重要的元素如点、线。
六、总结
劝退。
