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2022-12-25  本文已影响0人  生命数据科学
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1. 前情回顾

之前两期推送:
第一期(省流:ACE2不是SARS-COV-2的唯一靶点,文章仅证明UDCA能降低ACE2表达水平)
第二期(省流:如果要证明熊去氧胆酸通过下调ACE2的表达能够预防新冠还需要加一个隐藏条件:SARS-COV-2不会直接感染肺部,其造成的肺损伤可能是由其他组织感染引起的代偿反应(或者其他间接的机制),这样的话,就算ACE2在肺中表达量低,也不会影响说明熊去氧胆酸在预防新冠方面的作用

2. 本期内容

本期主要分析文章结果的第一部分:胆汁酸调节胆管细胞ACE2表达量

  1. 首先是胆管细胞表达ACE2水平在胆管树中最高
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    如上图a所示,一共有5种细胞被纳入研究:

图b是单细胞测序结果的UMAP图,根据算法进行降维后的分群结果,颜色代表不同的细胞类型,距离越近证明细胞的表达谱越相似

图c是基因在细胞中的表达水平,越红表达量越高

结合图b和图c1来看,ACE2主要表达于肝外胆管细胞和加了胆汁酸的COs中(图b负责定性,图c负责定量)

  1. 刚刚是mRNA水平,然后再来看蛋白水平染色情况,也表明了胆总管和胆囊中ACE2表达量较高(下图红色表示ACE2表达),而在肝内胆管中却几乎没有红色荧光,印证了单细胞测序的结果


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  2. 然后做了SARS-COV-2的免疫荧光染色,可以发现胆囊中感染情况是比较严重的,但滑稽的是,胆总管的结果这里并没有放出来 - -!。那么这里可以小问一下,ACE2表达量高,SARS-COV-2的水平一定高吗?


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  3. 之后,作者又在IHD,CBD和GB类器官中分别加入胆汁酸发现,加入胆汁酸之后组织中的ACE2水平都明显升高(图g),同时,在类器官中也发现类似效果,胆囊本身ACE2水平较高,加了胆汁酸CDCA的胆管类器官表达的ACE2与胆囊表达水平相当,胆囊标志物SOX17也显著升高(图h),免疫荧光表示加入胆汁酸CDCA后,胆管类器官中ACE2表达也会增加(图i)


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  4. 然后,图b又展示了胆汁酸CDCA处理后的胆管类器官高表达SARS-COV-2蛋白,并且病毒在其中还具有传染性(图c),导致了先天免疫和抗病毒反应应答(相关基因上调,图d)


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  5. 接下来展示了病毒感染后的死亡细胞的形态特征,产生病毒颗粒、形成病理性空泡和肿胀的线粒体(图e)


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那么,有胆汁酸的组织,表达ACE2;没有胆汁酸的组织,不表达ACE2,表明胆汁酸CDCA是ACE2表达所必须的,当然,所有实验都是胆管相关组织器官中进行的,对于在其他组织器官中是否适用,原文目前尚未提及

捋一捋本小节的思路,本文主要从原发组织到类器官,从肝外胆管到肝内胆管,从mRNA到蛋白质水平来验证了ACE2、SARS-CoV-2与CDCA的关系,比较严谨,实验也比较丰富,为后文引出UDCA作出了铺垫


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