生信问

R 问题解决 | 错误: With R version 3.5

2019-06-12  本文已影响0人  Biosciman

在使用如下代码安装Bioconductor来源的package时,

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("affy")

遇到如下报错:

错误: With R version 3.5 or greater, install Bioconductor packages using BiocManager; see https://bioconductor.org/install

解决方法:

先安装Bioconductor上的BiocManager package,然后用BiocManager::install()安装相应的package。

将代码改成如下:

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
  install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("rhdf5")

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