今天学到的一些linux操作命令

解压rar压缩文件

tar -xf GSE58831_RAW.tar 

批量解压gz压缩文件

for i in $(ls *.gz); do bgzip -d $i;done

cut指定分隔符分割文件

今天在一个群里看到有人提问批量更改fasta序列名称，他的fasta文件格式是

>seq1 | blabla
ATCG
>seq2 | bbbbb
ATCG

他想把序列名称竖线后面的内容都去掉，我自己想到的办法是python，识别大于号开头的行，然后用竖线分割字符串，在写到文件里就可以了，群里一位老师直接给出linux的cut命令

cat pra.fasta | cut -d "|" -f 1

简单明了

-d指定分隔符，-f指定输出分割后的第一列

还遇到了一个问题是

在linux系统下，管理员安装好的R语言，一些包都放到了指定的位置。每次在我自己的账户下想要调用这些包改如何实现，查到了一种方式是使用.libPaths()

比如R语言启动以后先输入命令

.libPaths(c("/A/B/C"))

c("/A/B/C") 是包的安装位置。这样的话可以调用，但是R退出以后再重新启动就又得重新设置。有没有办法可以一次设置，永久生效呢？因为可以使用，也没有继续找解决办法，先这样吧！

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