生信常用linux基础语法

移动目录下所有文件

find . -name "*.bam" -type f -exec mv {} ~/ChIP_seq/bam \; 
find . -name "*.bai" -type f -exec mv {} ~/ChIP_seq/bam \; 
find . -name "*.fastq.gz" -type f -exec mv {} ~/ChIP_seq/fastq \; 

批量重命名

ls *_all_indel.bed | while read id ;
do
mv $id `echo ${id%_all_indel.bed*}_all_indel.vcf`
done

awk筛选提取大文件