生信星球培训第九十一期

学习小组Day4笔记--小黄

2020-12-06  本文已影响0人  Kevin66_b50e

R语言基础学习

R与Rstudio的安装

因为之前想搞TCGA的数据分析来着,又不知道从何做起,看了很多教程都是用的R语言,所以这步就省了很多时间。没错,我之前下载了R和Rstudio,但是没有学习怎么使用(哭泣)这也是我加入学习小组学习的最大原因之一了。
但是之前还真就没意识到还有中文、英文路径的区别哈哈,只能说自己运气好。不过现在也了解解决方法啦~

认识R与Rstudio

这两者的区别我之前也没有了解过,不过在这次学习中了解到了:

R是一种编程语言,也是统计计算和绘图的环境,它汇集了许多函数,能够提供强大的功能。
R语言软件界面简陋,通常不直接使用,而是用图形界面的Rstudio。
RStudio是免费提供的开源集成开发环境(IDE)。RStudio提供了一个具有很多功能的环境,使R更容易使用,是在终端中使用R的绝佳选择。

同时也学着做了两个图(其实就是把代码简单的复制粘贴进去啦)

plot(rnorm(x,y,z)) 
#plot就是R语言很常用的绘图函数吧,
#rnorm可以生成x个均值是y标准差是z的随机数
#只写x就生成x个符合标准正态分布的随机数
这图长这样 plot(40,2,3).png
boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))
#boxplot指的是箱图
#iris是个数据集,用于数据分析,本次只是简单地用它做个图
#后面的是箱图的颜色选择
这图长这样 boxplot.png

鸢尾花(iris)是数据挖掘常用到的一个数据集,包含150种鸢尾花的信息,每50种取自三个鸢尾花种之一(setosa,versicolour或virginica)。每个花的特征用下面的5种属性描述萼片长度(Sepal.Length)、萼片宽度(Sepal.Width)、花瓣长度(Petal.Length)、花瓣宽度(Petal.Width)、类(Species)(突然感觉是个很有人文气息的统计学参数呢)

然后还有个改变Rstudio字体大小的,不赘述了,唯一注意的就是改完之后Rstudio会要求软件重启。

R语言基本操作

1.管理工作目录
setwd()设置工作目录
getwd()查看工作目录
还是用Exit下面那个create a project 图标最简单了!
建好了之后养成每次都从名称.Rproj进去,防止出现工作弄得乱七八糟的。

2.显示文件列表

dir()#查看当前目录(就是工作环境)的子目录和文件,功能与list.files()相同

3.计算&赋值
没想到吧,Rstudio可以直接计算!加减乘除乘方开方~直接输入然后回车就行了
赋值的话x<-()然后回车。
括号不用打,意思就是把后面的值赋给x,成功的话,在右上角的Environment可以看到Value下面出现了x和它的值。

4.删除变量
和Linux一样,命令为

rm(x)#删除变量x
rm(list = ls())#清空所有变量

5.查看历史命令
history()这个命令和点击右上角的History效果一样
在History中可以查看输入的历史命令

当你双击某个命令,他就会跳到你的控制台大于号后面了,可以修改后运行。

6.清空工作台
快捷键Ctrl+L
一定注意是快捷键,不是指令,不要输到控制台按回车!(没错,我就干过这事儿)

同时我也找到了R for Data Science这本书,有时间会好好学的!
今天的内容就是这些啦~

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