序列保守性分析及Seqlogo展示

2024-07-22  本文已影响0人  Yayamia

步骤一:多序列比对

  1. CSV与Fasta文件格式相互转化
  2. 序列比对在线网站(只能比对小于500条序列)
  3. 利用MEGA进行序列比对的教程

步骤二:Seqlogo展示

  1. 每个Logo由一系列碱基(氨基酸)组成,在每一个序列位置上用总高度表示此位置上的序列保守性,用碱基(氨基酸)字母的高度表示出现的频率
  2. 基于MEGA进行Weblogo展示 更推荐用MUSLE进行序列比对
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