转录组学习
2020-04-19 本文已影响0人
Wangxuann
conda create -n rna_seq 安装软件
经过质控后，采用STAR进行比对
虽然做的是无参转录组，但是别人提供的同一物种的reference genome组装质量还可以，所以考虑Trinity genome guide的组装方式，同时也做了de novo assemble进行了比较。
查找Trinity.fasta的ORF，因为Trinity的输出不都是以ORF开始。
eggnog对ORF预测结果进行同源注释
