【工具速递】使用 Chromap 快速对齐和预处理染色质图谱-F

标题：Fast alignment and preprocessing of chromatin profiles with Chromap
期刊：bioRxiv 
日期：06, 18, 2021

文章展示了 Chromap，这是一种用于对齐和预处理高通量染色质图谱的超快速方法。Chromap 在比对精度上与 BWA-MEM 和 Bowtie2 相当，比传统工作流程在批量 ChIP-seq / Hi-C 配置文件上快 10 倍以上，在单细胞 ATAC-seq 配置文件上比 10x Genomics 的 CellRanger v2.0.0 管道快 10 倍以上。开发者为生信领域大神李恒，同时也是samtools 和bwa的作者，刘小乐是表观层面特别是染色质修饰相关领域的专家，此项工具的开发可以为近期比较热门的ATAC-seq等表观层面数据分析提供便利，两位重量级人物共同推出的工具将更有针对性，值得我们深入测试使用。