数据库

SRA数据下载的三种方法

2021-03-04  本文已影响0人  AsuraPrince

首选方法:aspera下载(极快)

命令是ascp -QT -l 300m -P 33001 -i ~/miniconda3/etc/asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/srr/SRR100/005/SRR10052205 ./

注:miniconda3/etc/asperaweb_id_dsa.openssh是命令路径

/vol1/srr/SRR100/005/SRR10052205是文件名称非链接

方法二:prefetch下载(快,国内几乎不能用,极不稳定)

命令为:prefetch SRR10052205 (单个)

prefetch --option-file SRR_Acc_List.txt (批量下载)

方法三:Wget

具体软件安装查询云笔记

上一篇 下一篇

猜你喜欢

热点阅读