SRA数据下载的三种方法
2021-03-04 本文已影响0人
AsuraPrince
首选方法:aspera下载(极快)
命令是ascp -QT -l 300m -P 33001 -i ~/miniconda3/etc/asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/srr/SRR100/005/SRR10052205 ./
注:miniconda3/etc/asperaweb_id_dsa.openssh是命令路径
/vol1/srr/SRR100/005/SRR10052205是文件名称非链接
方法二:prefetch下载(快,国内几乎不能用,极不稳定)
命令为:prefetch SRR10052205 (单个)
prefetch --option-file SRR_Acc_List.txt (批量下载)
方法三:Wget
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