scFEA：单细胞转录组代谢通量分析

单细胞代谢分析我们之前分享过，例如基于scmetabolism包的，本质是对基因集合的评分。这次要介绍的scFEA(单细胞通量估计分析)也是基于单细胞转录组进行分析的。scFEA由人类代谢图谱作为重点代谢模块、利用scRNA-seq数据通量平衡约束的新型概率模型和基于图神经网络的新型优化求解器提供支持。利用多层神经网络捕获了从转录组到代谢组的复杂信息级联，以服从酶基因表达与反应速率之间的非线性依赖关系。具体原理感兴趣的可以读文章！我们演示了它的分析流程，以及一些下游可视化分析！相比于scmetabolism评分方式，scFEA的结果可能更具有优势！

scFEApaper原文：
https://genome.cshlp.org/content/early/2021/07/22/gr.271205.120.abstract
github网站：https://github.com/changwn/scFEA

我们的下游分析可视化结果如下：