Seurat: DefaultAssay()

2025-05-04  本文已影响0人  LET149

用来 查看指定 改变下游分析所使用的 assay slot

1. 查看使用的 assay

DefaultAssay(Seurat_object)

2. 指定使用的 assay

DefaultAssay("RNA"): 正常单个样本分析

DefaultAssay("HTO"): 用 HTO 数据进行 Cell hashing 后的样本分类

DefaultAssay("integrated"): 对整合(两个或者以上样本)后的数据进行下游分析

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