Seurat: DefaultAssay()
2025-05-04 本文已影响0人
LET149
用来 查看 和 指定 改变下游分析所使用的
assay slot
1. 查看使用的 assay
DefaultAssay(Seurat_object)
2. 指定使用的 assay
DefaultAssay("RNA"): 正常单个样本分析
DefaultAssay("HTO"): 用HTO数据进行Cell hashing后的样本分类
DefaultAssay("integrated"): 对整合(两个或者以上样本)后的数据进行下游分析