error: from Bio import SeqIO Imp

2020-11-02  本文已影响0人  铃_0d92

 1 我是如何解决问题的

 我重新安装了 anaconda、并通过anaconda安装了biopython和python(

conda install biopython  # 此命令默认(捆绑)安装python

今早一开始也还是报错,同样error,source后正常。

source ~./bashrc 

python XXX.py

python3 XXX.py

不论python还是python3都正常运行了

还是不清楚问题出在哪里,但有一点值得注意:

报错时,调动的是root用户安装的python

正常运行时,即source ~./bashrc 之后,调动的是我安装biopython时它默认安装的python

2 如何解决每次打开Xshell终端,都要source ~/.bashrc这个问题:  

 参考网址:https://www.jianshu.com/p/35ad1b375e50

vim ~/.bash_profile # 加载.bashrc文件

按 i 键入

if test -f .bashrc ; then

    source .bashrc

 fi

然后按ESC键,输入:wq保存并退出即可。

然后按ESC键,输入:wq保存并退出即可。

3  其他基本命令

1 查看是否安装python以及python的版本

python -V

which python

注意 Bio 大小写和python版本对应

python2 里面用的module是bio

python3 里用的module是Bio

安装或调用python3,biopython

1.安装,网上资料很多,这里就不写啦

2.调用python3很简单,就是将命令行里的python 换成python3

原命令: python  XXX.py

现命令:python3 XXX.py

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