Win10利用Ubuntu18.04子系统搭建科研环境
WIN10安装SWL(Ubuntu18.04)步骤:
1、点击左下角开始->设置->更新和安全->开发者选项->开发人员模式。
2、返回设置主界面->应用->应用和功能->右边相关设置中选择“程序和功能”->点击“启用或关闭windows功能”->在弹出的窗口中,拉到最下面,勾选上适用于Linux的Windows子系统,便会自动安装所需要的库,安装完毕后重启电脑。
3、进入Microsoft Store,搜索Ubuntu,选择Ubuntu18.04,选择获取,选择安装。
4、随后从开始菜单中启动Ubuntu子系统,可以看到还在安装最后组件,接着便是Ubuntu子系统用户名和密码的设置,设置好即可成功进入子系统。
5、更换清华镜像源,进入清华镜像网站的Ubuntu 镜像使用帮助页面(https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/help/ubuntu/),选择Ubuntu版本为18.04 LTS,复制文本框中的内容。
6、在子系统中,进入/etc/apt/目录,编辑sources.list文件,删除里面的内容,换为上一步复制的内容,保存。
7、更新软件列表和安装g++:
ubuntu系统通常自带gcc编译器,可以通过gcc -v查看编译器版本。
sudo apt-get update
sudo apt-get upgrade
sudo apt-get install build-essential
sudo apt-get install gdb
对于Fortran程序,由于微软的ifort是付费的版本,因此通常安装gfortran进行Fortran程序的编译
sudo apt-get install gfortran
8、安装GMT(一般不是GMT的最新版本,参考的GMT中文手册)
(GMT中文手册网址:https://docs.gmt-china.org/latest/install/linux/#ubuntu-debian)
sudo apt install gmt gmt-dcw gmt-gshhg
sudo apt install ghostscript gdal-bin graphicsmagick ffmpeg
9、安装 X Server - VcXsrv
(参考博客:https://blog.csdn.net/weixin_39689687/article/details/111655324)
WSL不自带图形界面,可以使用开源免费的 VcXsrv软件(网址https://sourceforge.net/projects/vcxsrv/)。
安装好后运行 Xlaunch,前两步配置直接回车使用默认配置,第三步把 Native opengl 关掉(以免影响 vtk、qt 等图形库的使用),即可开始运行 X Server。
在 WSL 这边:打开终端,修改DISPLAY 环境变量。可以把放到你的~/.bashrc里:
export DISPLAY=localhost:0
然后 source ~/.bashrc就可以正常使用了。
10、安装mpich
(参考博客:https://blog.csdn.net/qq_39451578/article/details/107938560)
MPI全程为Message Passing Interface,它并不是一种新的语言,而是消息传递接口。它定义了一个可以被C、C++ 和 Fortran 程序调用的函数库,用MPI可以进行进程间的通信,以消息传递的方式对分布式内存系统进行编程,从而实现并行计算。
直接安装(apt-get install mpich)在使用中可能会存在些许问题,因此推荐下载后自行编译安装。
先确保安装好gcc、g++、cmake 和 gfortran (sudo apt-get install cmake)
下载源码 wget https://www.mpich.org/static/downloads/3.0/mpich-3.0.tar.gz
解压及配置安装路径
sudo tar -zxvf mpich-3.0.tar.gz
sudo ./configure -prefix=/home/software/mpich3
编译和安装
sudo make
sudo make install
添加环境变量
export MPI_ROOT=/home/software/mpich3
export PATH=$MPI_ROOT/bin:$PATH
export MANPATH=$MPI_ROOT/man:$MANPATH
source ~/.bashrc
测试无误即安装成功。