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精选 | 2018年4月R新包推荐

2018-05-27  本文已影响28人  黄小伟Yeah

作者：Joseph Rickert

翻译：黄小伟，先后从事游戏、社交及金融数据研究及应用，目前就职网易杭州

2018年4月份，共有约212个R新包收录于CRAN，本文选摘了其中40个R包加以功能简述，有需要的爱好者可以自行下载帮助文档并安装R包进行使用。本文主要包括以下几个类别：计算方法、数据、数据科学、机器学习、音乐、科学、统计、时间序列、工具和可视化等.

一. 计算方法

  1. diffeqr : 支持对微分方程计算工具的调用接口(DifferentialEquations.jl)，提供了针对常微分方程(ODE)、随机微分方程(SDE)、时滞微分方程(DDE)、微分代数方程(DAE)等方程的高性能方法.
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  1. SimRepeat : 提供模拟统计方程的相关系统的功能，其中该方程可具有多种变量类型.

二. 数据

  1. echor : 提供美国环境保护局(EPA)环境合规历史在线(ECHO) 数据的访问接口.

  2. essurvey : 支持从欧洲社会调查（European Social Survey）下载所需数据.

  3. malariaAtlas : 支持从疟疾地图集项目(Malaria Atlas Project)服务器下载公共可用数据，并对其进行可视化分析.访问地址：https://map.ox.ac.uk/

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  1. salesforcer : 提供 Salesforce平台的访问接口.

三. 数据科学

  1. mleap : 为MLeap提供了一个sparklyr扩展，这是一个开放源码库，可以导出Apache Spark管道.

  2. rdfp : 提供谷歌DFP（ DoubleClick for Publishers）的访问接口.

访问地址：https://developers.google.com/doubleclick-publishers/

  1. workflowr : 提供了支持可重复性操作和团队协作的数据科学实施框架.

四. 机器学习

  1. aws.translate : 支持将一种语言的文本输入转换成另一种语言的文本输出（AWS Translate）.

  2. CBDA : 实现一个集合预测器（“超级学习者”），使用基于过滤和全面感知的方法对大数据进行分类.

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  1. featurefinder : 通过使用rpart分类和回归树对模型残差进行详细分析，实现了一种用于查找模型特征的方法.

  2. iilassso : 用可独立解释的Lasso实现用于拟合线性、逻辑回归模型的高效算法.

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  1. live : 通过了解关键因素，实施解释复杂机器学习模型的方法，

详见 Ribeiro et al. (2016) and Staniak and Biecek (2018).

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  1. mlrCPO : 提供了一套工具集，使得mlr（机器学习框架）更为丰富，可兼容多种预处理操作符（CPOS）.

7. varrank : 提供用于执行变量排序和特征选择的计算工具箱.

五. 音乐

1. tabr : 支持通过R代码利用乐谱软件（LilyPond）创建吉他谱的功能，可根据标记语言生成高品质的乐谱.

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六. 科学

1. DrInsight : 使用基于连接性测绘的药物重复利用工具，能够反向查询疾病表型或者查询与所查询药物具有类似功能的药物.

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七. 统计

1. cultevo : 提供测量信号系统组成的工具：信息论测量（2016）、距离矩阵相关性的Mantel检验（1983）等.

2. indirect : 提供使用独立的条件均值先验值的贝叶斯广义线性模型的函数.

3. konfound : 实现了反映灵敏度分析最新进展的方法，包括计算稳健性指数的函数.

4. mgc : 实现多等级图关联（MGC），在2017年由Shen等人开发.

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5. netregR : 提供将网络响应（有向和无向）回归到可能为演员、关系或网络值等感兴趣的协变量，并提供计算系数方差估计值的函数.

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6. RNGforGPD : 提供生成遵循广义泊松分布的单变量和多变量数据的函数.

7. SmartEDA : 提供自动描述数据结构和关系的功能，以便于探索性数据分析.

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8. stratifyR : 采用Khan等人的方法对单变量人群实施分层抽样设计.

9. WeMix : 提供运行混合效果模型的功能，其中包括每个级别的权重。遵循Rabe-Hesketh等人所提出的方法（2006），利用自适应正交的方法进行模型训练.

八. 时间序列

1. anomalize : 实现一个“整洁”工作流程，用于检测时间序列数据中的异常情况，支持分解时间序列、检测异常和将多个时间序列的正常数据与异常数据进行分离等功能.

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2. LPWC : 提供函数-基于加权相关和引入滞后，进行时间序列的距离度量.

九. 工具

1. table1 : 提供用于创建用于描述性统计的HTML表格的功能.

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2. foolbox : 提供一个操作函数的框架，并使用元编程来翻译.

3. graphframes : 提供了sparklyr包的扩展，提供了基于DataFrame的接口来处理图形.

4. komaletter : 提供用于书写字母的多功能R Markdown模板.

5. pkgnet : 使用图论的工具来分析R包中的函数与其导入的包之间的依赖关系，并量化它们的复杂性等.

6. promises : 提供了在R中进行异步编程的基本抽象.

十. 可视化

1. ERSA : 提供函数对回归计算的结果进行展示，同时该功能可以集成到shiny中进行可视化显示.

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2. ggplotify : 提供了将绘图函数调用转换为grob或ggplot的方法，使用户可以对齐由基本图形、网格、点阵和vcd函数生成的绘图.

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3. ggstatsplot : 对ggplot2进行扩展，生成带有统计试验结果的可视化图形.

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4. panelView : 提供使用二分法处理可视化面板数据的功能.

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5. prepplot : 提供一个单独的函数，用于创建基础绘图区域，可以轻松制作自定义图形.

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说明：限于个人水平，错误在所难免，欢迎批评指正、交流！

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